當過濾器的進出口壓差達到設定值時，或定時器達到預置時間，啟動反沖洗機構清洗濾元，此時磁場移出筒體，通過水氣反沖洗將吸附在濾元上的親磁性顆粒沖洗掉，通過排污管排出過濾器，反沖洗結束，過濾器沖洗恢復到過濾( 工作) 狀態(tài)為了節(jié)約改造成本，堿浸洗槽、堿刷洗槽和電解清洗槽共用一套磁過濾器裝置。
采用分別切換使用的控制方式，當磁過濾器使用一段時間后，要利用反沖洗泵對磁過濾器進行清洗，除去過濾器內的鐵粉、污物，從而保證過濾效果。此種高效率磁過濾器早期主要作為脫脂機組的重要設備由國外引進，后作為引進消化的成果已經國產化，并且在國產中低速熱鍍鋅線和連續(xù)退火機組的脫脂段循環(huán)系統(tǒng)中得到廣泛應用; 常用流量規(guī)格約為200~800L/min.
轉鼓式待過濾的液體通過引流裝置被引入磁過濾器，當液體流過磁鼓時，液體里所含的親磁性顆粒被吸附于磁鼓表面，由磁鼓轉動帶出液面并被刮刀刮除和分離; 被分離的液體通過下散流板重力溢流到下部箱體里。為了保證吸附效率和降低待過濾液體產生大量泡沫，盡可能保證液流平穩(wěn)緩慢。磁性轉鼓的外部卷筒上方安裝一刮刀，刮刀緊貼磁性轉鼓的外表面，便于去除粘附在轉鼓表面的鐵粉。
